blog上でのコード表示用にSyntaxHighlighterを利用していました。
WPに乗り換えるにあたって直接header.phpにJavaScriptの呼び出しを記述するのではなく、プラグインを利用することにしました。
Syntax Highlighter ComPress バージョン 3.0.83.3を利用しましたが、問題点が2点出ました。
まず1点目は縦スクロールが必要ない場面でも縦スクロールが出ることです。
これはwp-content/plugins/syntax-highlighter-compress/styles/shCoreDefault.cssを変更することで解消されました。

変更前

.syntaxhighlighter {
  width: 100% !important;
  margin: 1em 0 1em 0 !important;
  position: relative !important;
  overflow: auto !important;
  font-size: 1em !important;
}

変更後

.syntaxhighlighter {
  width: 100% !important;
  margin: 1em 0 1em 0 !important;
  position: relative !important;
  font-size: 1em !important;
  overflow-x: auto !important;
  overflow-y: hidden !important;
  padding: 1px !important;
}

次に管理画面に以下の警告が出るようになりました。

Notice: has_cap がバージョン 2.0.0 から非推奨になった引数付きで呼び出されました。ユーザーレベルの使用は推奨されていません。代わりに権限を使ってください。

検索したところ以下のページを見つけました。
「Notice: has_cap の使用は…」はプラグインを確認する
※既にリンク先のサイトはなくなっているようです。

要は数字ではなく文字列で権限を指定しろということらしいです。
で、Syntax Highlighter ComPressで該当する箇所はwp-content/plugins/syntax-highlighter-compress/syntax-highlighter-compress.php内のadd_submenu_page関数でした。
add_submenu_pageの75行目を以下のように修正したら無事警告も出なくなりました。

変更前

add_submenu_page('options-general.php', __('Syntax Highlighter ComPress Options', 'SHC'), $menutitle, 8, basename(__FILE__), 'shc_options_subpanel');

変更後

add_submenu_page('options-general.php', __('Syntax Highlighter ComPress Options', 'SHC'), $menutitle, 'administrator', basename(__FILE__), 'shc_options_subpanel');